Sobre

Biologista molecular, bioinformata

Olá, sou o Thyago! Sou um biologista molecular apaixonado por inovações científicas, bioinformática e edição gênica. Também sou forte defensor da ciência aberta, reprodutibilidade e código livre. Meu principal objetivo é usar biologia molecular e bioinformática para entendimento de fenômenos biológicos e explorá-los translacionamente para saúde humana. Durante minha pós-graduação trabalhei principalmente com biologia molecular, transcritômica e genômica aplicadas a doenças infecciosas, tendo experiência tanto em bancada molhada quanto computacional. Agora, estou utilizando edição epigenética com CRISPR-Cas para terapia de doenças neurodegenerativas.

Eu frequentemente uso R (estatística, formatação/limpeza de dados e visualização), Python (workflows com snakemake, automação e bibliotecas de aprendizado de máquina), Bash/Zsh (automação, administração linux). Também sou iniciante com C++ e Rust.

Meus hobbies favoritos são leitura, meditação, pintura a óleo, esportes ao ar livre, música, animais de estimação e aprender coisas novas.

Interesses
  • Biologia molecular
  • Bioinformática
  • Genética
  • CRISPR
  • Neurociência
Formação
  • Doutorado em Biologia Celular & Molecular (Biologia Molecular), 2022

    Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)

  • Mestrado em Biologia Celular & Molecular (Bioinformática), 2018

    Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ)

  • Bacharelado em Ciências Biológicas, 2016

    Universidade Federal de Goiás (UFG)

Habilidades

Biologia Molecular
Biologia Molecular
Bioinformática
Linux

(Ubuntu, Debian)

Git
GitHub
R

(tidyverse, caret, data.table)

Python
Markdown
latex
Latex
Bash/Zsh
Análise de dados
boxplot
Visualização de dados

ggplot2, lattice, ShinyApps

Docker
Bancos de dados
Open Science
adobe
Suíte Adobe

(Photoshop, Illustrator, After Effects, Premiere)

autodesk
Autodesk

(3Ds Max, Maya)

Ilustração científica
Web

Wordpress, Jekyll, Hugo

Biossegurança

Exp. em lab. BSL-3.

Experiência

 
 
 
 
 
Pesquisador de pós-doutorado
Feb 2023 – Presente Berkeley, Califórnia, EUA
Estou aplicando editores epigenéticos baseados em CRISPR-Cas para tratamento da Doença de Alzheimer.
 
 
 
 
 
Pesquisador de pós-doutorado
Jul 2022 – Jan 2023 Rio de Janeiro, Brasil
Compilei um workflow para análise de sequenciamento de genomas completos de M. leprae usando Snakemake e ambientes virtuais.
 
 
 
 
 
Consultor técnico
May 2022 – Jul 2022 São Francisco, Califórnia, EUA
Consultoria em bioinformática incluindo beta-testing, bug report, desenvolvimento de recurss e aconselhamento técnico.
 
 
 
 
 
Pesquisador (Doutorado)
Fiocruz/IOC/LAHAN
Aug 2018 – May 2022 Rio de Janeiro, Brasil
No meu doutorado eu utilizei transcritômica (sequenciamento de RNA) e biologia molecular para identificar biomarcadores e vias biológicas moduladas em hanseníase, visando aplicações translacionais. Trabalhei também em projetos de colaboradores aplicando bioinformática para genômica, como em sequenciamento direcionado de exomas, genotipagem com plataformas de baixa-média vazão e mapeamento de loci de caracteres quantitativos. Em paralelo, aprimorei minhas habilidades com biologia molecular, programação, delineamento experimental, banco de dados e métodos e técnicas visando reprodutibilidade científica.
 
 
 
 
 
Pesquisador (Mestrado)
Fiocruz/IOC/LAHAN
Jul 2016 – Jul 2018 Rio de Janeiro, Brasil
Minha dissertação foi sobre reanálise e integração microarranjos em hanseníase para identificar novas vias biólogicas importantes na doença. Durante esse período, adquiri habilidades com RT-qPCR, bioinformática, especialmente de -ômicas, programação, desenho de experimentos e visualização de dados. Por fim, estagiei no laboratório do Dr. Stewart Cole, em Lausana, Suíça, com sequenciamento de RNA, onde também trabalhei em um laboratório de biossegurança nível 3.
 
 
 
 
 
Iniciação Científica/Monitoria Acadêmica
UFG
Jul 2012 – Jul 2015 Goiás, Brasil
Durante a graduação eu trabalhei com microbiologia (Dra. Jupyracyara Barros), bioquímica (Dr. Geraldo Sadoyama) e biologia molecular (Dra. Adriana Neves), nas quais aprendi sobre cultura celular (eucar. e procar.), extração de ácidos nucleicos, PCR, SELEX para identificação de aptâmeros, clonagem molecular, identificação e teste de compostos antimicrobianos.

Contato

  • Berkeley Way, no. 2151, Berkeley, CA 94720
  • 2° piso, sala 220
  • Segunda-Sexta, das 08h00-17:00
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